1、含有微生物菌群，菌群的环境适应性强，易发挥出菌群优势，营养功能强，根际促生效果好，肥效高。
2、富含有机养分、无机养分，体积小，便于施用，能满足规模化生产和使用要求。
3、富含生理活性物质。
4、绿色无害。
5、对产量的影响：在减少化肥用量75%的条件下仍能达到甚至增加蔬菜产量。
6、对品质的影响：生物有机肥的增质主要表现在维生素C和β-胡萝卜素的增加、硝酸盐含量的降低。
7、对经济、社会及生态效益的影响：由于生物有机肥明显地增加了作物产量，改进了品质，特别是口味和外观较好，因而能取得较显著的经济效益。由于生物有机肥还有明显的改土培肥效果、提高肥料利用率和保护环境等功能，因此具有良好的社会生态效益。